美國西北大學(xué)的Simone Sredni主要研究一種名為惡性橫紋肌樣瘤的高侵襲性兒童腫瘤，最近她參與了該文庫的黑盒測試。Simone使用這一技術(shù)來篩查160種激酶突變后患者腫瘤細(xì)胞中產(chǎn)生的變化，從而找出影響細(xì)胞增殖和生長的突變。三個(gè)月后她得到了大部分的數(shù)據(jù)，并且發(fā)現(xiàn)了一些突變后可以減慢細(xì)胞生長的基因。她僅僅用了一年多一點(diǎn)的時(shí)間，她就已經(jīng)開始使用動物模型在體內(nèi)測試這些激酶抑制劑的效果了。“如果沒有這種篩查技術(shù)，我是絕對不可能做到的?！?/span>

該文庫有多個(gè)版本。用戶可以從19個(gè)不同的基因集中任意挑選，定制屬于自己的篩選方案，或者對18,000個(gè)基因進(jìn)行無差別篩選?！八粌H是市場上最高效的篩查技術(shù)，還在為不同需求構(gòu)建不同實(shí)驗(yàn)方案上給出了很大的可操作空間，”Thermo Fisher Scientific合成生物學(xué)研發(fā)部高級主管Jon Chesnut說道。

Sredni說，每個(gè)文庫售價(jià)10,000美元，可能有些貴，但是對于想要從事高效篩選的實(shí)驗(yàn)室來說，物有所值。

評委：任何將CRISPR技術(shù)帶入高通量水平的工作都是值得關(guān)注的。這是一個(gè)很好的輔助系統(tǒng)。雖然你也可以自己組建文庫，但這個(gè)系統(tǒng)提供了一種尋找基因生理功能的合理方法。

2008年NanoString首次推出了nCounter分析系統(tǒng)，這個(gè)可以識別特定分子熒光條形碼的自動化顯微成像系統(tǒng)，可以對mRNA進(jìn)行單分子定量檢測。NanoString計(jì)劃將該技術(shù)從mRNA拓展至DNA序列和蛋白質(zhì)的單分子定量。2016年，該公司終于達(dá)成這一目標(biāo)，推出了nCounter Vantage 3D Panels。

“升級后的Vantage檢測系統(tǒng)可以對mRNA、DNA、蛋白質(zhì)甚至蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行電子計(jì)數(shù)，”NanoString研發(fā)部高級副總Joe Beechem說。2016年4月，NanoString推出了第一款Vantage檢測系統(tǒng)，該系統(tǒng)可用于對肺癌和白血病樣本的RNA電子計(jì)數(shù)，也可用于實(shí)體瘤釋放的蛋白質(zhì)和免疫細(xì)胞信號分子，以及DNA單核苷酸位點(diǎn)突變的檢測。

德克薩斯大學(xué)MD安德森腫瘤中心系統(tǒng)生物學(xué)部主任Gordon Mills幫助研發(fā)了Vantage系統(tǒng)，并在安德森腫瘤中心扎耶德研究所將其應(yīng)用于癌癥的個(gè)性化治療?！翱捎糜趯?shí)驗(yàn)室檢測的平臺很多，”他說，“但是沒有一個(gè)能夠和nCounter Vantage一樣擁有結(jié)果穩(wěn)定性和操作簡便性，并且可以同時(shí)檢測患者樣本中的DNA、RNA和蛋白質(zhì)?！?/span>

nCounter分析系統(tǒng)售價(jià)149,000至280,000美元，使用nCounter Vantage 3D Panels測量單個(gè)樣本需花費(fèi)275美元或更多。不久的將來，NanoString和Mills實(shí)驗(yàn)室計(jì)劃推出能在單細(xì)胞水平上測繪生物分子空間分布的新版Vantage系統(tǒng)。

評委：這項(xiàng)技術(shù)可以同時(shí)測量少量樣品中的DNA、RNA和蛋白質(zhì)豐度，憑借這一點(diǎn)，它有可能成為今年最大的技術(shù)突破。這項(xiàng)技術(shù)推動了當(dāng)前的腫瘤學(xué)研究，將來還有可能被應(yīng)用于其他領(lǐng)域。這是一臺能夠測定多達(dá)800種指定DNA、RNA或蛋白質(zhì)的設(shè)備。